真菌基因組DNA提取試劑he 質(zhì)粒提取

NobleRyderD0188  真菌基因組DNA提取試劑he Fungi Genomic DNA                   Extraction Kit 

產(chǎn)品貨號(hào)：D0188

產(chǎn)品名稱：真菌基因組DNA提取試劑he Fungi Genomic DNA Extraction Kit

英文名稱：Fungi Genomic DNA Extraction Kit

產(chǎn)品規(guī)格：50T/100T

產(chǎn)品簡(jiǎn)介：

儲(chǔ)存條件：酶附件-20℃，其它試劑RT，復(fù)檢期1年

NobleRyderD0188  真菌基因組DNA提取試劑he真菌是具有真核和細(xì)胞壁的異養(yǎng)生物，種屬很多，已報(bào)道的屬達(dá)1萬(wàn)以上，種超過10萬(wàn)個(gè)。真菌通常又分為三類，即酵母菌、霉菌和蕈菌（大型真菌）。對(duì)于酵母菌和霉菌，可以用玻璃珠處理，而對(duì)于大型真菌，可直接用液氮研磨。經(jīng)過前期處理的菌液，用硅質(zhì)膜吸附，即可得到高純度的基因組。提取純化后的DNA，可以直接用于 PCR/Real time-PCR，sequencing，Southern blot，mutant analysis，SNP 等下游應(yīng)用實(shí)驗(yàn)。

本試劑盒適用于酵母菌和霉菌，可以用玻璃珠處理，經(jīng)過前期處理的菌液，用硅質(zhì)膜吸附，即可得到高純度的基因組。

具體產(chǎn)品的參數(shù)以收到產(chǎn)品說明書的參數(shù)為準(zhǔn)

操作步驟（僅供參考）：

使用前請(qǐng)先在漂洗液中加入無水乙醇，加入體積請(qǐng)參照瓶體上的標(biāo)簽（每瓶需要單獨(dú)添加45mL無水乙醇）。所有離心步驟均為使用臺(tái)式離心機(jī)在室溫下離心。

1、樣品處理：

1）對(duì)于酵母菌，取1-2mL培養(yǎng)好的菌液，離心收集，棄上清。加入200μL溶液A，加入2μLRNase A，再加入100mg玻璃珠，在高速振蕩器上振蕩，約5-10min。

2）霉菌(孢子也可相同處理)：取50-100mg菌絲，加200μL溶液A，用玻璃研磨器適當(dāng)研磨分散菌絲，加入2μL RNase A，再加入100mg玻璃珠，在高速振蕩器上振蕩，約30min。

3）大型真菌（建議）：稱取100-200mg樣品，倒入適量的液氮，立即研磨重復(fù)3次，使樣品研成粉末，加400μL的CTAB裂解液，加入2μL RNase A，再加入100mg 玻璃珠，在高速振蕩器上振蕩，約5min，后續(xù)再采用本試劑盒繼續(xù)提取。

2、 加入20μL的蛋白酶K，充分混勻，55℃水浴消化30min，消化期間可顛倒離心管混勻數(shù)次。 12000rpm離心2min。將上清轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的離心管中。如有沉淀，可再次離心。

3、在上清中加入200μL溶液B，充分混勻。如出現(xiàn)白色沉淀，可放55℃水浴5min，沉淀即會(huì)消失，不影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)。如溶液未變清亮，說明樣品消化不che底，可能導(dǎo)致提取的 DNA量少及不純，還有可能導(dǎo)致上柱后堵柱子，請(qǐng)?jiān)黾酉瘯r(shí)間。

4、再加入200μL無水乙醇，充分混勻，此時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)絮狀沉淀，不影響DNA的提取，將溶液和絮狀沉淀都加入吸附柱中，放置2min。

5、12000rpm 離心1min，棄廢液，將吸附柱放入收集管中。

6、向吸附柱中加入600μL漂洗液(使用前請(qǐng)先檢查是否已加入無水乙醇)，12000rpm離心1min，棄廢液，將吸附柱放入收集管中。

7、向吸附柱中加入600μL漂洗液，12000rpm離心1min，棄廢液，將吸附柱放入收集管中。

8、12000rpm 離心2min，將吸附柱置于室溫或50℃溫箱放置數(shù)分鐘，目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除，否則漂洗液中的乙醇會(huì)影響后續(xù)的實(shí)驗(yàn)如酶切、PCR等。

9、將吸附柱放入一個(gè)干凈的離心管中，向吸附膜中央懸空滴加50-200μL經(jīng)65℃水浴預(yù)熱的洗脫液，室溫放置5min，12000rpm離心1min。

10、離心所得洗脫液再加入吸附柱中，室溫放置2min，12000rpm離心2min，即可得到高質(zhì)量的基因組DNA。

注意事項(xiàng)：

1. 由于真菌種類萬(wàn)千，對(duì)于一些特別難處理的真菌，可用液氮研磨，再用玻璃珠振蕩，蛋白酶K處理，一般都可以得到一定量的基因組DNA，如電泳檢測(cè)很弱，一般PCR都會(huì)有較好結(jié)果。

2. 若溶液A或溶液B中有沉淀，可在55℃水浴中重新溶解。

3. 如果DNA提取量很少，可加長(zhǎng)玻璃珠處理時(shí)間，如果提取DNA成彌散短條帶，可減少玻璃珠處理時(shí)間。

4. 洗脫緩沖液的體積最好不少于50μL，體積過小會(huì)影響回收效率；洗脫液的pH值對(duì)洗脫效率也有影響，若需要用水做洗脫液應(yīng)保證其pH值在8.0左右(可用NaOH將水的pH值調(diào)至此范圍)，pH值低于7.0會(huì)降低洗脫效率；DNA產(chǎn)物應(yīng)保存在-20℃，以防DNA降解。

5. DNA 濃度及純度檢測(cè)：得到的基因組DNA片段的大小與樣品保存時(shí)間、操作過程中的剪切力等因素有關(guān)?；厥盏玫降?DNA 片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)檢測(cè)濃度與純度。DNA應(yīng)在OD260處有顯著吸收峰，OD260值為1相當(dāng)于大約50 μg/mL雙鏈DNA、40 μg/mL 單鏈 DNA

OD260/OD280比值應(yīng)為 1.7-1.9，如果洗脫時(shí)不使用洗脫緩沖液，而使用去離子水，比值會(huì)偏低，因?yàn)閜H值和離子存在會(huì)影響光吸收值，但并不表示純度低。

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